涉外稅收管理機關接到企業(yè)退（免）稅申報表后，經審核無誤，報上級涉外稅收管理機關審批后辦理；對于采用“免、抵、退”辦法以及采取先征后退辦法應予辦理退稅的，經上級涉外稅收管理機關審查后，送同級進出口稅收管理機關審批核準辦理退庫。 

      負責出口退稅審核的稅務機關在接到出口企業(yè)的退稅申報表時，亦必須嚴格按照出口退稅規(guī)定認真審核，確認無誤后，逐級報請有權審批的稅務機關審批，只有在批準后，才可填寫《收入退還書》，送當地銀行（國庫）辦理退稅。

      出口退稅審核的主要內容有：出口報關單原始單據、進項稅額原始單據、出口貨物銷售帳簿和應交稅金帳簿等。

      臺商投資企業(yè)提出的退稅申請手續(xù)齊備、內容真實的，當地涉外稅收管理機關必須自接到申請之日起，15日內審核完畢；上一級涉外稅收管理機關必須自接到有關材料后15日內審批完畢；進出口稅收管理機關必須在接到有關材料后，30日內辦完有關退稅手續(xù)。

4、稅款退付與退稅清算

（一）稅款退付是在出口退稅申報和審批之后，銀行依據《收入退還書》將出口退稅款從國庫退付到出口企業(yè)的開戶銀行帳戶的行為。出口貨物在辦理退稅手續(xù)后，如發(fā)生退關、國外退貨或轉為內銷，企業(yè)必須向所在地主管出口退稅的稅務機關辦理申報手續(xù)，補交已退（免）的稅款。

（二）退稅清算。出口企業(yè)要于年度終了后三個月內，進行上一年度出口退稅的清算，按規(guī)定期限向主管退稅機關報送“清算表”及相關資料由主管稅務機關進行全面清查。主管退稅機關在出口企業(yè)清算結束后兩個月內，對企業(yè)上報清算報表的清算資料進行清算核查，并向出口企業(yè)發(fā)出《清算情況通知書》說明以下問題：

1、出口企業(yè)的性質和清算范圍，出口貨物的品種、數量及銷售額，清算后出口企業(yè)應退稅款、已退稅款。

2、清算中發(fā)現的問題，多退、少退、錯退的金額。

3、清算處理結果及意見。