青海三江源地區(qū)地處青藏高原腹地，是長江、黃河、瀾滄江三大河流的發(fā)源地。歷史上，三江源區(qū)曾是水草豐美、湖泊星羅棋布、野生動(dòng)物種群繁多的高原草原草甸區(qū)，被稱為生態(tài)“處女地”。近些年來，隨著全球氣候變暖，冰川、雪山逐年萎縮，直接影響高原湖泊和濕地的水源補(bǔ)給，眾多的湖泊、濕地面積縮小甚至干涸，沼澤地消失，泥炭地干燥并裸露，沼澤低濕草甸植被向中旱生高原植被演變，生態(tài)環(huán)境已十分脆弱。隨著人口的無節(jié)制增加和人類無限度的生產(chǎn)經(jīng)營活動(dòng)，又大大加速了該地區(qū)生態(tài)環(huán)境惡化的進(jìn)度。特別是草地大規(guī)模的退化與沙化，不僅使該地區(qū)草地生產(chǎn)力和對(duì)土地的保護(hù)功能下降，優(yōu)質(zhì)牧草逐漸被毒、雜草所取代，一些草地危害動(dòng)物如鼠類乘虛而入，導(dǎo)致草地載畜量減少，野生動(dòng)物棲息環(huán)境質(zhì)量減退，棲息地破碎化，生物多樣性降低。更為重要的是，隨著源區(qū)植被與濕地生態(tài)系統(tǒng)的破壞，水源涵養(yǎng)能力急劇減退，導(dǎo)致三江中下游廣大地區(qū)旱澇災(zāi)害頻繁、工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)受到嚴(yán)重制約，并已直接威脅到了長江、黃河流域、乃至東南亞諸國的生態(tài)安全。
這一地區(qū)的嚴(yán)峻形勢引起了黨和政府及國際社會(huì)的廣泛關(guān)注。1999年，中國探險(xiǎn)協(xié)會(huì)組織了水資源專家與其他科學(xué)家對(duì)瀾滄江的綜合考察，通過考察提出了“開發(fā)大西北，保護(hù)三江源”的建議。這一建議得到國家林業(yè)局、青海省政府、中國科協(xié)及中國科學(xué)院和有關(guān)部門的重視與支持。2000年2月2日，國家林業(yè)局以林護(hù)自字[2000]31號(hào)文《關(guān)于請(qǐng)盡快考慮建立青海三江源自然保護(hù)區(qū)的函》下發(fā)青海省。青海省人民政府立即組織有關(guān)部門編寫了青海三江源省級(jí)自然保護(hù)區(qū)規(guī)劃初步意見，并在2000年3月21日，由國家林業(yè)局、中國科學(xué)院和青海省人民政府聯(lián)合召開了“青海三江源自然保護(hù)區(qū)可行性研討會(huì)”，會(huì)議認(rèn)為：“中華水塔”面臨著嚴(yán)重威脅，建立三江源自然保護(hù)區(qū)是西部大開發(fā)中生態(tài)環(huán)境建設(shè)的一大戰(zhàn)略任務(wù)，不僅將為西部地區(qū)的開發(fā)創(chuàng)造良好的自然環(huán)境，也為我國及東南亞各國的經(jīng)濟(jì)發(fā)展及生態(tài)安全提供重要保證。加強(qiáng)三江源區(qū)的生態(tài)保護(hù)是歷史賦予中國人民的重要使命，不僅意義重大，而且刻不容緩。目前，建立保護(hù)區(qū)的時(shí)機(jī)和條件基本成熟，要不失時(shí)機(jī)地推進(jìn)三江源自然保護(hù)區(qū)的建設(shè)。會(huì)后，青海省人民政府經(jīng)過認(rèn)真調(diào)研，于2000年5月批準(zhǔn)建立三江源省級(jí)自然保護(hù)區(qū)，并于2001年9月批準(zhǔn)成立了青海三江源自然保護(hù)區(qū)管理局。
三江源自然保護(hù)區(qū)的建立受到了黨和國家領(lǐng)導(dǎo)人的高度重視，江澤民總書記親筆題寫了“三江源自然保護(hù)區(qū)”碑名，人大常委會(huì)副委員長布赫題寫了碑文，表達(dá)了中國政府對(duì)生態(tài)環(huán)境保護(hù)的決心。為具體落實(shí)江澤民總書記“再造一個(gè)山川秀美的西北地區(qū)”的重要指示，為西部大開發(fā)創(chuàng)造一個(gè)良好的生態(tài)環(huán)境，國家林業(yè)局將三江源自然保護(hù)區(qū)建設(shè)作為全國重點(diǎn)林業(yè)生態(tài)建設(shè)工程的“旗艦工程”，已先期于2001年投資啟動(dòng)實(shí)施。
2001年8月，國家級(jí)自然保護(hù)區(qū)評(píng)審委員會(huì)辦公室派出專家組赴三江源地區(qū)進(jìn)行了實(shí)地考察，國家環(huán)境保護(hù)總局、國家林業(yè)局、農(nóng)業(yè)部、水利部也派員參與了考察。依據(jù)這次考察的成果，國家林業(yè)局規(guī)劃院和三江源保護(hù)區(qū)管理局依制定三江源保護(hù)區(qū)2001-2010年的10年建設(shè)總體規(guī)劃。2003年1月，國務(wù)院正式批準(zhǔn)三江源自然保護(hù)區(qū)晉升為國家級(jí)?！肚嗪Ｈ磭壹?jí)自然保護(hù)區(qū)總體規(guī)劃》就是在原有規(guī)劃的基礎(chǔ)上，按照國家級(jí)保護(hù)區(qū)總體規(guī)劃編制要求、結(jié)合三江源保護(hù)區(qū)及主管部門提出的修改意見進(jìn)一步修改而成。該規(guī)劃將作為青海三江源自然保護(hù)區(qū)中長期建設(shè)的綱領(lǐng)性文件。
